2012 – GENOTIPIZZAZIONE DI CEPPI DI BRACHYSPIRA HYODYSENTERIAE ISOLATI IN ITALIA ATTRAVERSO IL SEQUENZIAMENTO MULTILOCUS (MULTILOCUS SEQUENCE TYPING)
Parole chiave: Brachyspira hyodysenteriae, MLST, Italia, Dissenteria emorragica, epidemiologia
molecolare, sensibilità agli antimicrobici
Lo scopo di questo lavoro è stato quello di applicare la tipizzazione tramite Multilocus sequence typing (MLST) a 52 ceppi Brachyspira hyodysenteriae provenienti da 43 differenti aziende italiane localizzate in 14 province del Nord e del Centro Italia, isolati nel periodo di tempo compreso tra il 2003 ed il 2011. Per 47 di questi ceppi era noto il valore di Minima Concentrazione Inibente (MIC) nei confronti delle pleuromutiline tiamulina e valnemulina. MLST applicata a 7 loci (adh, alp, est, gdh, glpK, pgm, thi) di B. hyodysenteriae ha permesso di confrontare la realtà italiana con i 111 ceppi tipizzati utilizzando lo stesso metodo a livello mondiale. Dodici profili allelici (ST) sono stati individuati tra i ceppi italiani, di cui 11 nuovi e uno precedentemente descritto in ceppi isolati in Germania e Belgio. Un significativo allontanamento dell’equilibrio genetico è stato rilevato tramite il calcolo dell’indice di associazione IA, confermando la struttura prevalentemente clonale delle popolazioni di ceppi di B. hyodysenteriae. I 12 ST individuati in Italia possono essere raggruppati in 4 gruppi clonali (Cc) e 2 ST restano come singolarità non raggruppabili. L’analisi di questi gruppi clonali nei confronti dei ceppi sequenziati a livello mondiale è dettagliata nel testo. Relativamente al profilo di suscettibilità alle pleuromutiline, nessun Cc permette di separare ceppi sensibili e ceppi a ridotta sensibilità in modo statisticamente significativo. Il protocollo di tipizzazione utilizzato è risultato particolarmente robusto e sufficientemente discriminatorio da poter essere utilizzato per lo studio della epidemiologia molecolare e della diversità dei ceppi di B. hyodysenteriae presenti sul territorio italiano.
