2018 – I VIRUS DELL’INFLUENZA SUINA IN NORD ITALIA: CO-CIRCOLAZIONE DI DIVERSI GENOTIPI ED EVENTI DI RIASSORTIMENTO
Parole chiave: influenza suina, genotipi, novel
Il consorzio Europeo per la sorveglianza dei virus influenzali suini (European Surveillance Network for in influenza in pigs – ESNIP) tra il 2009 e il 2013 ha caratterizzato geneticamente i virus circolanti nei Paesi aderenti creando un nuovo modello di classificazione (Watson et al. 2015). In totale sono stati caratterizzati 290 virus e definiti 25 diversi genotipi nominati da A a W. Il presente lavoro è il frutto della sorveglianza passiva condotta in Veneto e Friuli Venezia Giulia tra il 2013 e il 2017. In totale sono stati rilevati 15 allevamenti positivi al virus, localizzati in 15 differenti comuni di 4 diverse provincie. Con il fine di definire i genotipi circolanti nel territorio, il genoma completo dei 33 virus è stato caratterizzato mediante Illumina MiSeq. L’analisi filogenetica condotta per i virus classificati come H1 ha mostrato come questi appartenessero a 4 differenti genotipi: 1B.1.2.2 (humanlike H1N2), 1A.3.3.2 (A(H1N1) pdm09), 1C.2 e 1C.2.1 (avian like H1N1 and H1N2). Le analisi filogenetiche condotte sull’intero genoma hanno identificato 8 differenti genotipi, di cui 6 precedentemente descritti in Europa (A, B, D, F, P e T) e 2 (X e Y), descritti nel presente lavoro per la prima volta. Considerando il potenziale zoonosico dell’influenza suina, la sorveglianza e la caratterizzazione molecolare dei virus circolanti si dimostra necessaria per monitorare l’emergenza di virus con potenziale pandemico.
